Στο πρώτο κομμάτι της εργασίας εξετάζονται βασικές μέθοδοι για τη μέτρηση των μηχανικών ιδιοτήτων κυττάρων και βιομορίων. Παρουσιάζονται πιο αναλυτικά οι μέθοδοι:
Atomic Force Microscopy (AFM)
Optical Trapping ("optical tweezers")
Magnetic Bead Microrheometry
Micropipette Aspiration
Στη συνέχεια αναλύονται ορισμένα βασικά μοντέλα κυτταρικής συμπεριφοράς
Lumped parameter viscoelastic model of the cell
Tensegrity model of the cytoskeleton
Modeling actin filaments as a foam
Computational model of a chondrocyte in its matrix
Στο τελευταίο μέρος, εξετάζεται το πείραμα micropipette aspiration σε χονδροκύτταρο in vivo. Με βάση τις πειραματικές μετρήσεις (βίντεο του πειράματος του F. Guilak, που δόθηκε από τον καθηγητή Λ. Αλεξόπουλο) και χρησιμοποιώντας το μοντέλο Kelvin (από το κεφάλαιο Lumped parameter viscoelastic model of the cell) υπολογίζονται οι σταθερές ελαστικότητας και απόσβεσης του χονδροκυττάρου.
Downloads: Εδώ μπορείτε να κατεβάσετε την παρουσίαση, καθώς και ολόκληρη την εργασία που περιλαμβάνει πιο αναλυτική περιγραφή των μεθόδων και του υπολογιστικού μέρους. Η βιβλιογραφία περιλαμβάνεται στο τέλος της εργασίας.
2012-2013
Methods to measure the mechanical properties of cells & Models of cellular biomechanical behavior:
Πετρόπουλος Ηλίας (email: iliasptr@gmail.com)
Σωτηρόπουλος Εμμανουήλ (email: maneedos.ms@gmail.com)
Στο πρώτο κομμάτι της εργασίας εξετάζονται βασικές μέθοδοι για τη μέτρηση των μηχανικών ιδιοτήτων κυττάρων και βιομορίων. Παρουσιάζονται πιο αναλυτικά οι μέθοδοι:
Στη συνέχεια αναλύονται ορισμένα βασικά μοντέλα κυτταρικής συμπεριφοράς
Στο τελευταίο μέρος, εξετάζεται το πείραμα micropipette aspiration σε χονδροκύτταρο in vivo. Με βάση τις πειραματικές μετρήσεις (βίντεο του πειράματος του F. Guilak, που δόθηκε από τον καθηγητή Λ. Αλεξόπουλο) και χρησιμοποιώντας το μοντέλο Kelvin (από το κεφάλαιο Lumped parameter viscoelastic model of the cell) υπολογίζονται οι σταθερές ελαστικότητας και απόσβεσης του χονδροκυττάρου.
Downloads:
Εδώ μπορείτε να κατεβάσετε την παρουσίαση, καθώς και ολόκληρη την εργασία που περιλαμβάνει πιο αναλυτική περιγραφή των μεθόδων και του υπολογιστικού μέρους. Η βιβλιογραφία περιλαμβάνεται στο τέλος της εργασίας.